Den 10-årige Arthur (Freddie Highmore) er på besøg hos sin bedstemor (Mia Farrow), som bor alene i et stort hus ude på landet. Desværre er der stor risiko for, at huset skal rives ned, hvis Arthurs bedstemor ikke betaler en stor sum penge. Arthur beslutter, han vil hjælpe. Takket være en gammel bog, kommer han på sporet af en skjult rubinskat, som befinder sig hos de bittesmå Minimoysere, der bor i baghaven. På magisk vis kommer Arthur til Minimoysernes verden, hvor han har tre dage til at finde skatten. Men inden da skal han også lige forhindre en invasion og nedkæmpe en ond troldmand.
