Batkid Begins inleder berättelsen den 15 november 2013, då San Francisco blev Gotham City och ett intensivt spontant stöd spred sig runt om i världen. Under en dag, i en stad, förenades världen för att en femårings önskan skulle gå i uppfyllelse. Den lille killen hette Miles Scott, och återhämtade sig från blodcancer, och drömde om att bli Batkid. En enkel önskan som började med Make-A-Wish-Foundation i San Francisco-området, växte till att folk runt om i världen aktivt hejade på Miles, även President Obama och filmsuperhjältar. En sådan önskan och denna lilla Batman gjorde ett sådant intryck att filmskaparen Dana Nachman inspirerades att ta reda på vad som händer när ett litet event för att uppfylla en önskan utan ansträngning sprider sig viralt, så att det till slut avslöjar förvånande sanningar om vad som händer när någon inspirerar samhället i IT-åldern.
